بخش عمده‌ای از طراحی‌ها و بهینه‌سازی‌هایی که در مرکز تحقیقات انجام می‌شود، قبل از اجرای صنعتی همواره با استفاده از نرم‌افزارهای مختلف مورد شبیه‌سازی و ارزیابی قرار می‌گیرد. این واحد پردازش سریع با هدف افزایش سرعت محاسبات شبیه‌سازی‌های دینامیکی و سیالاتی با سرمایه‌گذاری ۴۰۰ میلیون ریال در اسفندماه سال ۱۳۹۲ راه‌اندازی شده است.
این واحد مجهز به دو سوپرکامپیوتر است، که امکان استفاده هم‌زمان ۵ کاربر را فراهم کرده است. این سیستم‌ها با بهره‌مندی از قویی‌ترین پردازنده مرکزی (CPU) و کارت گرافیک (GPU) روز دنیا، یکی از قوی‌ترین سیستم‌های موجود در جنوب شرق کشور شناخته می‌شود و همواره جوابگوی نیازهای مرکز تحقیقات و سایر مراجعین از دانشگاه‌ها و صنایع مجاور بوده است.
پردازنده‌های مرکزی قدرتمند این واحد، این زمینه را ایجاد کرده است که بتوان از نرم‌افزارهایی که هسته محاسباتی آنان به قدرت CPU وابسته است را بدون مشکل اجرا کند. از طرفی در سال‌های اخیر بسیاری از نرم‌افزارهای مهندسی، جهت کاهش زمان انجام محاسبات، محاسبات خود را بر روی کارت گرافیک انجام می‌دهند لذا در راه‌اندازی این واحد این نکته نیز در نظر گرفته شد و قدرتمندترین و کمیاب‌ترین کارت‌های گرافیک دنیا تهیه و بر روی این سیستم‌ها نصب گردید.
علاوه بر این دو سوپرکامپیوتر، یک نمایشگر سه‌بعدی نیز در این واحد تعبیه‌شده تا بتوان درک صحیح‌تر و دقیق‌تری از نتایج شبیه‌سازی‌ها به دست آورد و قبل از اجرای صنعتی طرح‌های جدید، که معمولاً هزینه‌های زیادی دارند، اطمینان لازم را بیش‌ازپیش به دست آورد.
این واحد توسط تعدادی مهندس باتجربه و مسلط به زبان‌های برنامه‌نویسی و سخت‌افزار مدیریت می‌شود که توانایی طراحی و تولید هر نوع نرم‌افزار مهندسی، بر اساس استانداردهای برنامه‌نویسی روز دنیا، را دارا هستند. این گروه، پشتیبانی سخت‌افزاری و نرم‌افزاری این مجموعه و سایر مراجعه‌کنندگان را نیز عهده‌دار هستند.
